Subsydia przyznawane są przez FNP na drodze zamkniętego konkursu, obejmującego co roku jeden z czterech poniższych obszarów:

• obszar I: nauki o życiu i o Ziemi
• obszar II: nauki chemiczne i o materiałach
• obszar III: nauki matematyczno-fizyczne i inżynierskie
• obszar IV: nauki społeczne i humanistyczne.

Kandydatów do subsydium nominują wnioskodawcy (uznane autorytety naukowe z danego obszaru dziedzinowego). Na tej podstawie Fundacja tworzy listę zaproszonych do udziału w konkursie. Ci z zaproszonych uczonych, którzy zechcą w nim uczestniczyć, przedstawić powinni informację o swoich zamierzeniach naukowych wraz z projektem wykorzystania subsydiów. Zarząd Fundacji wyłania laureatów posiłkując się opiniami recenzentów.

Subsydium może trwać do 12 do 36 miesięcy i obejmuje:

• imienne stypendium laureata,
• część stypendialną przeznaczoną na finansowanie stypendiów dla młodych naukowców,
• część subwencyjną, którą laureat może rozporządzać zgodnie ze swoim uznaniem, przeznaczając środki finansowe na zakup książek i czasopism naukowych, aparatury, specjalistycznych programów komputerowych i materiałów niezbędnych do prowadzenia badań, na udział w konferencjach, finansowanie krótkich wyjazdów naukowych, organizowanie seminariów oraz środki na publikacje prac naukowych w najlepszych czasopismach typu Open Access,
• narzut jednostki zatrudniającej laureata w wysokości do 5% (naliczany od części subwencyjnej).

 W tym roku Fundacja wyłoniła dziewięciu wybitnych naukowców, którzy otrzymają subsydia w wysokości ok. 300 tys. zł (na realizację dwu- i trzyletnich projektów z obszaru nauk chemicznych i o materiałach):

• Prof. dr hab. Grzegorz Chałasiński (Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii)
• Prof. dr hab. Piotr Garstecki (Instytut Chemii Fizycznej PAN w Warszawie)
• Prof. dr hab. Ewa Górecka (Uniwersytet Warszawski, Wydział Chemii)
• Prof. dr hab. Daniel Gryko (Instytut Chemii Organicznej PAN w Warszawie)
• Prof. dr hab. Grzegorz Karczewski (Instytut Fizyki PAN w Warszawie)
• Prof. dr hab. inż. Janusz Zbigniew Lewiński (Instytut Chemii Fizycznej PAN w Warszawie)
• Prof. dr hab. Józef Adam Liwo (Uniwersytet Gdański, Wydział Chemii)
• Prof. dr hab. inż. Marek Samoć (Politechnika Wrocławska, Wydział Chemiczny)
• Prof. dr hab. Jacek Ulański (Politechnika Łódzka, Wydział Chemiczny)

Uroczyste wręczenie dyplomów laureatom programu MISTRZ odbędzie się 24 października 2013 r., w godzinach 13:00- 15:00 w Auli Głównej (9B) Wydziału Biologii Uniwersytetu Warszawskiego w Warszawie. Gościem specjalnym uroczystości będzie prof. Brian Kobilka, laureat Nagrody Nobla w dziedzinie chemii, który wygłosi wykład nt. „Structural insights into G protein coupled receptor activation.”