Jednym z podstawowych zadań biologii molekularnej i genomiki jest analiza transkrypcji genów. Podczas kursu omówione zostaną zarówno dziś już standardowo stosowane metody (Real Time PCR, mikromacierze), nowe znajdujące coraz to szersze zastosowanie (RNAseq) jak również dopiero co pojawiające się i jeszcze praktycznie nieznane w Polsce (NanoString, spektrometria mas DNA, bezpośredni pomiar częstotliwości inicjacji transkrypcji). Niniejszy kurs umożliwi Państwu praktyczne i teoretyczne zapoznanie się z przygotowaniem bibliotek do RNAseq i real Time PCR. Kierowany jest on zarówno do osób, które pracują w laboratoriach jak i do osób, które tylko teoretycznie wykorzystują metody molekularne w swojej pracy.
1 dzień |
|
09:00 – 09:15 |
Otwarcie kursu |
09:15 – 10:15 |
Real Time i digital PCR – wykład I |
10:15 – 11:00 |
Wydzielanie RNA – ćw. 1 |
11:00 – 11:30 |
Sprawdzenie jakości wydzielonego RNA – ćw. 2 |
11:30 – 12:30 |
Oczyszczenie RNA od śladów DNA – ćw. 3 |
12:30 – 12:45 |
Sprawdzenie oczyszczenia RNA od DNA – ćw. 4 |
12:45 – 13:00 |
Przygotowanie biblioteki RNAseq – ćw. 5 Cz. 1. Synteza pierwszej nici cDNA |
13:00 – 13:15 |
Pomiar ekspresji genów – qPCR – ćw. 6 Cz. 1. Synteza cDNA z oligo dT |
13:15 – 14:00 |
Przerwa |
14:00 – 14:15 |
Interpretacja wyników ćwiczeń 1 i 2 |
14:15 – 14:30 |
Przygotowanie biblioteki RNAseq – ćw. 5 Cz. 2. Synteza drugiej nici cDNA |
14:30 – 15:30 |
Analiza ekspresji genów metodą Real Time PCR – wykład II |
15:30 – 15:45 |
Interpretacja wyników ćwiczeń 3 i 4 |
15:30 – 16:00 |
Pomiar ekspresji genów – qPCR – ćw. 6 Cz. 2. Real Time PCR |
2 dzień |
|
09:00 – 09:15 |
Interpretacja wyników ćwiczenia 6 |
09:15 – 09:30 |
Przygotowanie biblioteki RNAseq – ćw. 5 Cz. 4. Fragmentacja DNA |
09:30 – 10:00 |
Przygotowanie biblioteki RNAseq – ćw. 5 Cz. 5. Oczyszczenie produktu i tagmentacja |
10:00 – 10:15 |
Sprawdzenie jakości fragmentacji DNA – ćw. 7 |
10:15 – 11:15 |
RNAseq – wykład IV |
11:15 – 11:30 |
Przerwa |
11:30 – 11:45 |
Przygotowanie biblioteki RNAseq – ćw. 5 Cz. 5. Amplifikacja biblioteki |
11:45 – 12:45 |
Mikromacierze DNA i białkowe– wykład III |
12:45 – 13:00 |
Przygotowanie biblioteki RNAseq – ćw. 5 Cz. 6. Oczyszczenie biblioteki i pomiar ilości, interpretacja wyników |
13:00 – 14:00 |
Demo mikromacierze DNA, spektrometria mas DNA, sekwenatory nowej generacji |
14:00 |
Zakończenie |
Prowadzący: Dr hab. Tadeusz Malewski oraz mgr Ewa Suchecka
Termin: 26 – 27 marca 2015 roku
Miejsce: Muzeum i Instytut Zoologii PAN, ul. Wilcza 64 Warszawa
Karty Zgłoszenia oraz opłaty należy przesyłać do dnia 24 marca 2015 r.
Ponieważ ilość miejsc jest ograniczona organizatorzy zastrzegają sobie prawo do wcześniejszego zamknięcia listy w przypadku wyczerpania wolnych miejsc.
Dodatkowych informacji udziela:
Dr Arleta Malewska: mbs@mbs.biz.pl, Tel (22) 401 10 38; 607 929 471
Opłata za udział w kursie wynosi 1420 zł brutto.
Opłata obejmuje:
Opłatę należy wpłacić na konto:
MBS Szkolenia, Konferencje, Usługi Sp. z o.o.
03-766 Warszawa, ul. Grajewska 6/8 m. 26
Bank Polska Kasa Opieki S.A. Oddział w Warszawie
80 1240 6074 1111 0010 4915 6042
NIP 113 286 12 19; REGON 146448470; KRS 0000444499
Przy wpłacie prosimy o podanie nazwiska osoby, której udział w kursie jest opłacany.
Uczestnicy otrzymają certyfikat ukończenia szkolenia