Zespół badaczy z Agricultural Research Service (ARS) w Stanach Zjednoczonych stwierdził, że porównywalnie szybko i tanio można zidentyfikować genetyczne markery zarówno w genomie winogron, jak i w innych roślinach przy pomocy nowoczesnej technologii sekwencjonowania.

Naukowcy uważają, że wraz z obniżeniem kosztów technik sekwencjonowania DNA i genotypowania pojawi się duże zainteresowanie w szybkiej identyfikacji genomu przy pomocy takich technik, jak genome-wide association study (GWA study) * oraz mapowanie i genetyczna selekcja (GS) w organizmach z jeszcze mało poznanym genomem. Dodają, że obecnie są prowadzone badania w kierunku odkrycia szybszej i tańszej metody identyfikacji genomu o dużym znaczeniu gospodarczym, np. winogrona.Tradycyjna produkcja wina z winogron jest zbyt długa i droga, a ponadto czas rozwoju owoców trwa około trzech lat.

Wykorzystując kombinacje markerów genetycznych w genomie winogron odpowiedzialnych za określone cechy takie, jak jakość owoców, adaptacja do środowiska naturalnego, odporność przed chorobami i szkodnikami badaczy skonstruowali specyficzne filtry, które pozwalają na szybką korektę błędów w sekwencjonowaniu genomu. Dzięki czemu zidentyfikowano tysiące wysoko jakościowych pojedynczych polimorfizmów w nukleotydach (SNPS), które są genetycznymi markerami przekazującymi sygnały pomiędzy roślinami.

Badacze odkryli ponad 9 tys. SNPS, które zawierały wystarczającą informację o stosunkach oraz pochodzeniu upraw roślin.
____________________________________________________________________________________________________

* genome-wide association study (GWA study) jest ot metoda badania genetycznych wariacji w danym genomie, która pozwala na identyfikacje powiązań pomiędzy genotypem a fenotypem. Analiza ta jest oparta na wykorzystaniu dwóch grup organizmów, gdzie jedna z nich posiada badany gen, a druga - nie. Po przeprowadzeniu genotypowania każdej grupy zestaw markerów SNPS jest zapisywany na komputerze.