Pracownia Wysokorozdzielczej Spektrometrii Masowej
Jednostka: Wydział Chemii
Kategoria: analityka chemiczna
Słowa klucze (tagi): analizy proteomiczne, analizy grupy lipidów
Tematyka badań naukowych:
- badania proteomiczne i lipodemiczne w chorobach afektywnych.
Potencjalne zastosowanie prowadzonych badań naukowych:
- wczesna diagnostyka i ocena postępów terapeutycznych w chorobach afektywnych;
- materiał: krew (pacjenci), preparaty tkankowe pobrane od zwierząt (obrazowanie białek i lipidów).
Aparatura badawcza dostępna do działalności komercyjnej:
- spektrometr mas z desorpcją/jonizacją laserową wspomaganą matrycą i podwójnym analizatorem czasu przelotu MALDI-TOF MS (ultrafleXtreme, Bruker Daltonik, Niemcy 2011);
- nanochromatograf cieczowy (EASY-nLC II, Bruker Baltonik, Niemcy 2011);
- kolektor frakcji współpracujący z nanochromatografem (PROTEINEER fc II, Bruker Daltonik, Niemcy 2011).
Potencjalne usługi badawcze:
- analizy proteomiczne – identyfikacja białek oraz analiza ich modyfikacji potranslacyjnych, PTMs (przy użyciu oprogramowania BioTools) z wykorzystaniem metody:
- Peptide mass fingerprinting (PMF) – badanie “odcisku placa mapy peptydowej”,
- Top-down sequencing (TDS-ISD),
- analiza oligonukleotydów;
- analiza grupy lipidów przy użyciu techniki TLC-MALDI (w szczególności fosfolipidów);
- obrazowanie MALDI (MALDI IMS).
Stosowane metody i techniki badawcze:
- MALDI-TOF MS, MALDI-TOF/TOF MS, LC-MALDI, TLC-MALDI, MALDI IMS.
Wykonywane zlecenia:
- identyfikacja białek (na podstawie eksperymentów PMF, TDS), analiza modyfikacji potranslacyjnych białek (PTMs) z wykorzystaniem oprogramowania BioTools;
- analiza związków makrocyklicznych;
- analiza polimerów syntetycznych (analiza grup końcowych).
Kontakt: cittru@uj.edu.pl
____________________________________________________________________________________________________
High Resolution Mass Spectrometry Laboratory
Faculty: Faculty of Chemistry
Category: chemical analysis
Catchword (tags): proteomic analyses, analysis of lipid classes
Scientific research subjects:
- proteomics and lipidomics study in affective disorders.
Potential application of scientific research:
- diagnostic of the affective disorders on early step and evaluation of the progress of therapy;
- material: blood from the patients and tissue slices from animal (protein and lipids imaging).
Research apparatus available to commercial activity:
- matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometer with double time-of-flight analyzer MALDI-TOF/TOF MS (ultrafleXtreme, Bruke Daltonik, Germany, 2011);
- liquid nanochromatograph (EASY-nLC II, Bruker Daltonik, Germany, 2011);
- fraction collector co-operating with the nanochromatograph (PROTEINEER fc II, Bruker Daltonik, Germany, 2011).
Potential research services:
- proteomic analyses – identification of proteins and analysis of their post-translational modifications, PTMs (BioTools software) with the use of:
- peptide mass fingerprinting (PMF),
- top-down sequencing (TDS),
- analysis of nucleic acids (oligonucleotides);
- analysis of lipid classes with the use of TLC-MALDI (esp. phospholipids);
- MALDI Imaging (MALDI IMS).
Methods and research techniques:
- MALDI-TOF MS, MALDI-TOF/TOF MS, LC-MALDI, TLC-MALDI, MALDI IMS.
Performed contract research:
- identification of proteins (on the basis of PMF and TDS experiments), analysis of protein posttranslational modifications (PTMs) with the use of BioTools software;
- analysis of macrocyclic compounds;
- analysis of synthetic polymers (end group analysis).
Contact: cittru@uj.edu.pl
