Zajmujemy się identyfikacją modyfikacji potranslacyjnych takich jak deamidacja, formylacja itp.
Identyfikacji i lokalizacji modyfikacji potranslacyjnych dokonujemy bazując na analizie MS/MS peptydów powstałych w wyniku proteolizy badanego białka z wykorzystaniem dedykowanego enzymu (np.: trypsyna, Glu-C, Lys-C, Asp-N). Proces prowadzony jest w oparciu o przeszukiwanie baz danych sekwencji białkowych z użyciem systemu MASCOT®. Przed przystąpieniem do trawienia, mostki dwusiarczkowe w białkach zazwyczaj poddawane są redukcji i alkilacji. Do symulacji widm fragmentacyjnych modyfikowanych peptydów wykorzystywany jest program GPMAW (Lighthouse data).
