Postdoctoral Researcher w Pracowni Hipoksji i Epigenomiki Nowotworów

Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN poszukuje kandydata na stanowisko:

Postdoctoral Researcher w Pracowni Hipoksji i Epigenomiki Nowotworów

 

Liczba stanowisk: 1

Miejsce wykonywania pracy: Pracownia Hipoksji i Epigenomiki Nowotworów

Profil zawodowy badacza (R1-R4): R2-R3

Dziedzina nauki: biologiczna lub pokrewna

Typ i rodzaj konkursu: NCN Sonata Bis

 

Opis projektu

Glejaki pediatryczne o wysokim stopniu złośliwości (z ang. paediatric high-grade gliomas, pHGGs) występujące w pniu mózgu są jedną z głównych przyczyn śmiertelności u dzieci wywołanej przez choroby nowotworowe. Znaczącym problemem w leczeniu tych guzów jest brak możliwości ich chirurgicznego usunięcia, gdyż wiązałoby się to z ogromnym ryzykiem naruszenia struktur pnia mózgu i zaburzenia podstawowych czynności życiowych u pacjentów. Główną metodą leczenia jest radioterapia, która jedynie tymczasowo hamuje przebieg choroby, a mediana przeżywalności u pacjentów z DMG wynosi około 9-11 miesięcy od czasu diagnozy. Dlatego też istnieje ogromna potrzeba polepszenia skuteczności radioterapii.

Mutacja wykryta w histonie H3 (nazywana mutacją H3K27M) w glejakach linii środkowej u dzieci (z ang. diffuse midline gliomas H3K27-altered, DMGs) znacznie zaburza modyfikacje epigenetyczne H3 i przez to globalnie zmienia charakterystykę chromatyny w tych guzach, powoduje błędną ekspresję genów, co wspiera wzrost guza. Na etapie diagnozy, guzy DMG osiągają duże rozmiary i zawierają rozległe obszary z obniżonym poziomem tlenu, tak zwaną hipoksją. Z wyników badań w innych rodzajach guzów wiemy, że hipoksja ma ogromny wpływ na epigenetyczne modyfikacje histonów, przez co dodatkowo programuje właściwości i upakowanie DNA oraz aktywację poszczególnych genów. Bardzo ważne jest szczegółowe poznanie reakcji komórkowych na hipoksję, gdyż dane kliniczne pokazują, że im większe jest niedotlenienie guza, tym mniejsze są szanse na przeżycie pacjenta. Obecność hipoksji ma też szczególne znaczenie w guzach leczonych radioterapią, gdyż brak tlenu znacznie obniża szkodliwość promieniowania jonizującego dla komórek nowotworowych, przez co spada efektywność terapii. Co ważne, rola hipoksji w kształtowaniu DMG jest wciąż mało znana. W naszym projekcie skupimy się na zbadaniu słabych punktów w DMG, które są zależne zarówno od obecności H3K27M oraz są zależne od hipoksji. W tym celu przeprowadzimy analizę wpływu hipoksji na zmiany epigenetyczne w histonach, w upakowaniu DNA oraz w aktywacji ekspresji genów w komórkach nowotworowych z mutacją H3K27M. Pracownia ma ugruntowaną współpracę zarówno z lekarzami w warszawskim Centrum Zdrowia Dziecka (IPCZD, Prof. Wiesława Grajkowska, Prof. Joanna Trubicka) zajmującymi się przypadkami DMG, jak również z międzynarodowymi specjalistami zajmującymi się epigenetyką (Prof. Jakub Mieczkowski, GUMED) oraz tematyką nowotworów DMG (Prof. Javad Nazarian, Zurich oraz Prof. Jacek Majewski, Montreal).

 

Zakres zadań na stanowisku:

• charakterystyka przeprogramowania chromatyny pod wpływem hipoksji w komórkach DMG,
• analiza dostępności chromatyny (ATACseq), wybranych modyfikacji histonów (CUT&RUN), metylacji DNA oraz kontaktów w chromatynie (HiC), które są zaburzone pod wpływem hipoksji i obecności H3K27M,
• prowadzenie dokumentacji z przeprowadzanych badań,
• regularne zaznajamianie się z literaturą dotyczącą tematyki projektu,
• udział w pisaniu manuskryptów jak również prezentowanie wyników na seminariach oraz konferencjach naukowych,
• samodzielne i kreatywne podejmowanie wyzwań badawczych związanych z projektem jak również praca razem z pozostałymi członkami zespołu.

 

Procedura i termin przyjmowania zgłoszeń:

Forma składania ofert: elektronicznie na adres: postdoc@nencki.edu.pl z dopiskiem „KL” do 09 maja 2025.

 

Wymagane dokumenty:

• CV z listą publikacji,
• krótki list motywacyjny (do 1 strony A4),
• kopia dyplomu PhD,
• dane kontaktowe do 2-3 osób w celu uzyskania referencji,
• oświadczenie kandydata, że nie będzie pobierał wynagrodzenia z innych projektów finansowanych przez Narodowe Centrum Nauki.
• oświadczenie, że kandydat nie podejmie innej pracy w okresie zatrudnienia w projekcie.

 

Dane kontaktowe:

Kierownik Pracowni Dr Katarzyna Leszczynska: k.leszczynska@nencki.edu.pl

Link do strony internetowej Pracowni: https://nencki.edu.pl/laboratories/laboratory-of-tumour-of-hypoxia-and-epigenomics/

Strona Pracowni jest obecnie w przygotowaniu. Jeden z projektów toczących się w laboratorium to: https://hit-glio.eu/

 

Prosimy o zamieszczenie w CV następującej klauzuli:

Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych zawartych w niniejszym formularzu rekrutacyjnym przez Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN z siedzibą w Warszawie przy ulicy Pasteura 3 (administrator danych), na potrzeby rekrutacji na stanowisko określone w ogłoszeniu, zgodnie z Rozporządzeniem Parlamentu Europejskiego i Rady UE 2016/679 z dnia 27 kwietnia 2016 r. w sprawie ochrony osób fizycznych w związku z przetwarzaniem danych osobowych i w sprawie swobodnego przepływu takich danych oraz uchylenia dyrektywy 95/46/WE w ramach realizacji obowiązku prawnego ciążącego na administratorze danych (art.6 ust.1 lit. a ) oraz ustawą z dnia 10 maja 2018 r. o ochronie danych osobowych (Dz.U.2018 poz.1000).