ANALIZA FUNKCJONALNA SEKWENCJI DNA U EUKARIOTA
Sekwencjonowanie genomu jest dopiero wstępem do zrozumienia funkcjonowania organizmu na poziomie molekularnym. Kolejnym etapem jest odnalezienie w sekwencji rejonów kodujących białka oraz RNA nie kodujących białka (miRNA, lcnRNA i inne) a następnie przewidzenie ich funkcji w organizmie.
Pierwszym etapem regulacji ekspresji genów jest transkrypcja. Transkrypcja genów jest regulowana przez wiele czynników, część z nich można zidentyfikować analizując sekwencje DNA komputerowo.
Kolejnym etapem regulacji ekspresji jest translacja. miRNA reguluje ekspresję wielu genów degradując ich mRNA lub blokując translację. Sekwencje w mRNA rozpoznawane przez miRNA można również zidentyfikować komputerowo i określić jakie miRNA mogą regulować ekspresję danego genu na etapie translacji.
Jak połączyć cały zasób wiedzy na temat działania konkretnej komórki w jedną całość? W pewnym stopniu pozwalają to zrobić narzędzia opracowane przez Genome Ontology Consortium.
Podczas szkolenia uczestnicy praktycznie zapoznają się z komputerowymi metodami identyfikacji genów kodujących białka, identyfikacji sekwencji rozpoznawanych przez miRNA, miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych oraz ontologią genów.
PROGRAM SZKOLENIA
I dzień |
|
09:00 – 09:10 |
Otwarcie szkolenia |
09:10 – 10:10 |
Identyfikacja rejonów kodujących białka w sekwencjach DNA - wykład I |
10:10 – 11:10 |
Programy do annotacji sekwencji DNA - wykład II |
11:10 – 11:25 |
Przerwa |
11:25 – 12:25 |
Znajdowanie genów kodujących białka w sekwencji DNA (programy AUGUSTUS, GeneID, GenScan, Beijing Gene Finder) - ćwiczenie 1 |
12:25 – 13:25 |
RNA niekodujące białek i możliwości ich komputerowej identyfikacji - wykład III |
13:25 – 13:40 |
Przerwa |
13:40 – 14:40 |
Identyfikacja genów, których ekspresja może być regulowana przez miRNA (ComiR, miRmap) - ćwiczenie 2 |
14:40 – 15:40 |
Transkrypcja, regulacyjne rejony genów i ich struktura - wykład IV |
II dzień |
|
09:00 – 10:00 |
Programy i metody bioinformatycznej analizy promotorów i enhancerów - wykład V |
10:00 – 11:30 |
Identyfikacja miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych w promotorach (programy LASAGNA, MAPPER2) - ćwiczenie 3 |
11:30 – 11:45 |
Przerwa |
11:45 – 12:45 |
Ontologia genów (GO) - model sieci powiązań między genami, białkami i ich funkcjami - wykład VI |
12:45 – 14:00 |
Ontologia genów - PANTHER - ćwiczenie 4 |
14:00 |
Zakończenie szkolenia |
Prowadzący: Dr hab. Tadeusz Malewski
Termin: 21 - 22.06 czerwca 2018
Miejsce: Centrum Edukacyjne Pankiewicza, ul. Pankiewicza 3, Warszawa
Karty Zgłoszenia oraz opłaty należy przesyłać do dnia 15 czerwca 2018
Ponieważ ilość miejsc jest ograniczona organizatorzy zastrzegają sobie prawo do wcześniejszego zamknięcia listy w przypadku wyczerpania wolnych miejsc.
Dodatkowych informacji udziela:
Dr Arleta Malewska: mbs@mbs.biz.pl, Tel (22) 668 24 83; 607 929 471
Opłata za udział w kursie wynosi 1400 zł netto + 23% VAT
Opłata obejmuje:
Opłatę należy wpłacić na konto:
MBS Szkolenia, Konferencje, Usługi Sp. z o.o.
03-766 Warszawa, ul. Grajewska 6/8 m. 26
Bank Polska Kasa Opieki S.A. Oddział w Warszawie
80 1240 6074 1111 0010 4915 6042
NIP 113 286 12 19; REGON 146448470; KRS 0000444499
Przy wpłacie prosimy o podanie nazwiska osoby, której udział w kursie jest opłacany.
Uczestnicy otrzymają dyplom ukończenia szkolenia