Biotechnologia.pl
łączymy wszystkie strony biobiznesu

Kalendarium

Analiza danych RNA-seq w R (2-dniowy warsztat online)
Data rozpoczęcia:
2020-05-08
Data zakończenia:
2020-05-09
Organizator:
Xenstats sp. z o.o.
Miejsce
WARSZTAT ONLINE

Analiza danych RNA-seq w R (Poznań/2-dniowy warsztat)

Kurs rozpoczniemy od krótkiego wstępu dotyczącego podstaw R, po czym przejdziemy do przedstawienia specyfiki analiz danych wysokoprzepustowych, jakimi są dane pochodzące z eksperymentu RNA-seq. Zapoznamy Państwa z wstępną analizą takich danych tj. analizą jakości, mapowaniem oraz wstępną filtracją i normalizacją, a następnie przejdziemy do analizy wyższego rzędu czyli analizy różnicowej i ontologii genowej. Przekazujemy wiedzę praktyczną popartą przykładami, ćwiczeniami oraz tzw. case study. Kurs ma na celu wprowadzić w podstawy analiz dużych zbiorów danych next generation sequencing (NGS).

Termin: 8 i 9 maja 2020, 10:00-15:00.

Miejsce: warsztat online.

Grupa: maks. 10 osób - liczba wolnych miejsc: 2

Wykładowca: Dr inż. Joanna Zyprych-Walczak.

Cena: 1000 zł netto (1230 zł brutto).

Zagadnienia:

Krótkie wprowadzenie do R. Pakiet dplyr

Podstawowe statystyki opisowe: miary tendencji centralnej, miary rozrzutu, analiza rozkładu danych

Podstawowe wykresy

Podstawy wizualizacji danych: pakiet ggplot2

Wprowadzenie do RNA-seq i Bioconductor

Analiza jakości, mapowanie, zliczanie countów

Testy zgodności, niezależności

Podstawowe testy statystyczne dla danych NGS: edgeR, deseq, limma

Analiza GO i KEGG

Wizualizacja wyników

Case study

 

Rejestracja na szkolenie odbywa się poprzez formularz zgłoszeniowy dostępny TUTAJ

Newsletter