Biotechnologia.pl
łączymy wszystkie strony biobiznesu
Przydatność profilowania genetycznego do określenia niszy dla rozwoju komórek dendrytycznych.
04.12.2007
Profilowanie genetyczne przynosi wielorakie dane dotyczące ekspresji genów u jednego osobnika. Jak podają w ostatnim Immunology and Cell Biology autorzy z Australii, Sekwencje, które nie uległy replikacji mogą być użyte do porównywania populacji komórek w zależności od ich pochodzenia (linii komórkowej) oraz funkcji. Despars i wsp. wyznaczyli sobie jako cel dostarczenie szybkiej informacji o ekspresji genów lub jej braku jako przejawowi określonej linii komórkowej lub typu komórki przy braku jednoczesnego pomiaru ekspresji wszystkich genów. Zestaw danych użytych do tej analizy reprezentował ekspresję genów w zrębie śledziony STX3 wspomagającego rozwój komórek dendrytycznych oraz zrębu węzłów chłonnych 2RL22, które rozwoju komórek dendrytycznych nie wspomagają. Dane te zostały pozyskane dzięki użyciu chipów genetycznych Affymetrix U74Av2. Użycie kryterium wartości p do zidentyfikowania genów, które z wysokim prawdopodobieństwem zróżnicowanej ekspresji zostało użyte do wykrycia genów o takiiej właśnie charakterystyce. genu, które związane są ze środowiskiem niszy dla procesu hematopoezy zostały wybrane do dalszych badań w celu opracowania charakterystyki komórek wspomagających zrębu organów limfoidalnych


Immunology and Cell Biology (2007) 85, 567–570
KOMENTARZE
Newsletter