Genotypowanie SNP wykorzystuje się między innymi w poszukiwaniu markerów genetycznych chorób. Metody analizy SNP oparte są między innymi o hybrydyzację sond, metodę wydłużania specyficznego primera, ligację czy specyficzne cięcie za pomocą enzymów restrykcyjnych. Ze względu na ogromną liczbę SNP w genomie człowieka wciąż poszukuje się nowych, wysoko wydajnych, tanich i nieskomplikowanych metod ich analizy, które umożliwiałyby badanie tysięcy prób równocześnie.

Metoda nazwana nanofluidic Dynamic Arrays (nanoprzepływowe mikromacierzemacierze dynamiczne) została zastosowana do analizy średniej wielkości, z jej pomocą można badać od 30 do 300 SNP, jest szybka (około 3 godzin do uzyskania wyniku), tania i charakteryzuje się niskim odsetkiem błędów. Jedna płytka mikromacierzowa wykorzystywana w tej metodzie posiada około 2 tysięcy dołków reakcyjnych o objętości kilku nanolitrów. Analiza opiera się na reakcji Real-Time PCR z wykorzystaniem sond TaqMan®, dane zbierane są za pomocą BioMark™Real-Time PCR System firmy Fluidigm.

Źródło: High-throughput single nucleotide polymorphism genotyping using nanofluidic Dynamic Arrays.Wang J., Lin M., Crenshaw A., Hutchinson A. I in., BMC Genomics 2009, 10:561, 28 November 2009