Biotechnologia.pl
łączymy wszystkie strony biobiznesu
Test sprzętu laboratoryjnego: Genetic Analyzer 3130 Applied Biosystems®
Anna Staszewska, 13.03.2014
W kolejnej odsłonie z cyklu artykułów „Praktycy dla praktyków: testy sprzętu laboratoryjnego”, prezentujemy niezależną opinię na temat użytkowania sprzętu laboratoryjnego, przygotowaną przez pracownika Celther Polska. Firma prowadzi dwa laboratoria biologii komórki i obrazowania.

Applied Biosystems® 3130 Genetic Analyzer jest sekwenatorem, który wykorzystuje elektroforezę kapilarną. Urządzenie jest łatwe w obsłudze i w pełni zautomatyzowane, począwszy od załadunku polimeru, poprzez wprowadzenie próbek, aż po ich oznaczenie i analizę danych. Zaletą jest fakt, że kapilara wytrzymuje dwa razy więcej sekwencjonowań niż przewiduje producent. Ponadto producent gwarantuje zsekwencjonowanie do 960 par zasad, podczas gdy w praktyce, używając odpowiedniej jakości materiału, można osiągnąć wydajność nawet do ponad 1500 par zsekwencjonowanych zasad.

 

Oczywistym dla użytkownika powinien wydawać się fakt, że w pobliżu sprzętu należy maksymalnie dbać o czystość, jak najmniejszą ilość kurzu i pyłu oraz zapewnić właściwą cyrkulację powietrza. 

Sekwenator wyposażony jest w 4 kapilary, dzięki czemu jest możliwość zsekwencjonowania jednocześnie 96 próbek. Ponadto, istnieje możliwość użycia kapilar o 4 różnych długościach (najdłuższa 80 cm), dzięki czemu możliwa jest analiza sekwencyjna dłuższych produktów reakcji. 

Urządzenie obsługiwane jest przez 3 programy: Sequencing Software, SeqScape Software oraz GeneMapper Software, do następujących aplikacji, np.: 

  • sekwencjonowanie de novo
  • sekwencjonowanie porównawcze, 
  • resekwencjonowanie (VariantSEQr, mitoSEQr), 
  • minisekwencjonowanie (detekcja SNP), 
  • identyfikacja heterozygot, 
  • identyfikacja osobnicza ludzi, 
  • identyfikacja bakterii i grzybów do gatunku (MicroSeq), 
  • genotypowanie koni, psów, bydła (StockMarks), 
  • AFLP mikroorganizmów i roślin, 
  • analiza sprzężeń (Linkage Mapping Set), 
  • analiza SNP (SNaPshot, SNPlex), SSCP, HMA, LOH, MLPA.

Zaletą sekwenatora kapilarnego niewątpliwie jest to, że wymaga on mniejszej ilości próbki DNA w porównaniu z technologią wykorzystującą elektroforezę żelową. Ponadto, ulepszona regulacja temperatury sprawia, że wyniki są dokładniejsze i powtarzalne.

 

Dalsza część opisu dpostępna POD TYM ADRESEM

 

 

 

 

Źródła

LABORANT.PL

KOMENTARZE
news

<Luty 2025>

pnwtśrczptsbnd
27
28
29
30
31
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
1
2
Newsletter