Biotechnologia.pl
łączymy wszystkie strony biobiznesu

Farmacja, Biotechnologia

WYSZUKIWANIE W BAZACH SEKWENCJI PODOBNYCH DO BADANEJ. PORÓWNYWANIE SEKWENCJI.
Data rozpoczęcia:
2014-08-28
Data zakończenia:
2014-08-28
Miejsce
Warszawa
Link do strony

Jednym z podstawowych elementów komputerowej analizy sekwencji jest określanie podobieństwa pomiędzy sekwencjami DNA lub białek. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) to rodzina programów pozwalających na szybkie przeszukiwanie baz sekwencji i znajdowanie sekwencji podobnych do sekwencji użytej jako zapytanie.

 

09:00 – 09:10

Otwarcie warsztatów

09:10 – 10:30

Główne bazy sekwencji genomowych - wykład

10:30 – 11:30

Przyrównania lokalne i globalne  - wykład

11:30 – 11:45

Przerwa

11:45 – 12:45

Programy do przeszukiwania baz i określania stopnia podobieństwa badanych sekwencji  - wykład

12:45 – 13:45

Wyszukiwanie podobnych sekwencji  - BLAST - ćwiczenie

13:45 – 14:00

Przerwa

14:00 – 15:00

Wyszukiwanie podobnych sekwencji  – BLAT (Blast Like Alignment Tool); elektroniczny PCR - ćwiczenie

15:00 – 16:00

Przyrównanie wielu sekwencji (multiple alignment) – Clustal, Mega5 - ćwiczenie

16:00

Zakończenie warsztatów

Newsletter