Kurs odbędzie się 24 czerwca 2016 r. na Wydziale Biologii UAM w Poznaniu (ul. Umultowska 89).
Przeznaczony dla wszystkich osób, które chcą zapoznać się z podstawowymi zagadnieniami związanymi z sekwencjonowaniem nowej generacji. Niezależnie od tego, czy planują Państwo analizować dane samodzielnie, czy współpracować ze specjalistami w tej dziedzinie, na pewno warto wzbogacić swoją wiedzę o tego typu zagadnienia. Od uczestników kursu nie jest wymagana umiejętność programowania.
Wyniki sekwencjonowania w technologii NGS (wykład + zajęcia komputerowe) W jaki sposób dane powstają, są przechowywane, obrabiane i zastosowane w przykładowych projektach badawczych. Poznamy bazy danych i formaty plików oraz przeprowadzimy kontrolę jakości danych NGS (FastQC, FASTX Toolkit, Trimmomatic). |
Mapowanie (wykład + zajęcia komputerowe) Mapowanie krótkich odczytów pochodzących z technologii DNA–Seq (Bowtie, BWA) oraz RNA–Seq (Tophat, STAR). Poznamy rózne strategie i metody, ich wady i zalety. |
Seminarium W ramach seminarium porozmawiamy o NGS i o zastosowaniu tej technologii w Państwa projektach. |