Biotechnologia.pl
łączymy wszystkie strony biobiznesu

Farmacja, Biotechnologia, Kosmetologia

Wprowadzenie do obróbki danych NGS
Data rozpoczęcia:
2016-02-12
Data zakończenia:
2016-02-12
Miejsce
Wydział Biologii UAM w Poznaniu

Przeznaczony dla wszystkich osób, które chcą zapoznać się z podstawowymi zagadnieniami związanymi z sekwencjonowaniem nowej generacji. Niezależnie od tego, czy planują Państwo analizować dane samodzielnie, czy współpracować ze specjalistami w tej dziedzinie, na pewno warto wzbogacić swoją wiedzę o tego typu zagadnienia. Od uczestników kursu nie jest wymagana umiejętność programowania.

 

Oto zagadnienia, które zostaną poruszone podczas kursu:
 

Wyniki sekwencjonowania w technologii NGS (wykład + zajęcia komputerowe)

W jaki sposób dane powstają, są przechowywane, obrabiane i zastosowane w przykładowych projektach badawczych. Poznamy bazy danych i formaty plików oraz przeprowadzimy kontrolę jakości danych NGS (FastQC, FASTX Toolkit, Trimmomatic).


 

Mapowanie (wykład + zajęcia komputerowe)

Mapowanie krótkich odczytów pochodzących z technologii DNA–Seq (Bowtie, BWA) oraz RNA–Seq (Tophat, STAR). Poznamy rózne strategie i metody, ich wady i zalety.


 

Seminarium

W ramach seminarium porozmawiamy o NGS i o zastosowaniu tej technologii w Państwa projektach.


 

Zachęcamy do rejestrowania się. Koszt uczestnictwa wynosi 400 zł.
Informacje organizacyjne można znaleźć na stronie FAQ.

Newsletter