Biotechnologia.pl
łączymy wszystkie strony biobiznesu

Farmacja, Biotechnologia, Kosmetologia

Przygotowanie bibliotek do sekwencjonowania DNA na sekwenatorach nowej generacji
Data rozpoczęcia:
2017-10-06
Data zakończenia:
2017-10-07
Miejsce
Warszawa

Przygotowanie bibliotek do sekwencjonowania DNA na sekwenatorach

nowej generacji

 

Jednym z podstawowych zadań biologii molekularnej jest poznanie struktury i funkcji genomów. Rozwój metod pozwala sekwencjonować DNA coraz szybciej i dokładniej. Obecnie na rynku są aparaty kilku producentów – Illumina (MiSEQ, HiSEQ, NextSEQ), Thermo Scientific (PMG, Proton, SOLID), Pacific Biosciences (PACBIO RSII). Obiecującym graczem jest Oxford Nanopores. Mają one różne możliwości i ograniczenia. Użytkownicy mogą wybrać odpowiadający im aparat lub zlecić sekwencjonowanie. Kluczowym momentem, wspólnym dla wszystkich aparatów jest właściwe przygotowanie bibliotek. Niniejszy kurs umożliwi Państwu praktyczne i teoretyczne zapoznanie się z przygotowaniem bibliotek do sekwencjonowania DNA.

 

PROGRAM KURSU

 

I dzień

09:00 – 09:10

Otwarcie kursu

09:10 – 10:10

Przygotowanie DNA i sekwencjonowania na NGS i planowanie eksperymentów –  wykład I

10:10 – 10:40

Wydzielanie DNA –  ćw. 1

10:40 – 11:00

Ocena wyizolowanego DNA – ćw. 2

11:00 – 11:20

Fragmentacja DNA – ćw. 3

11:20 – 12:10

Oczyszczanie fragmentowanego DNA – ćw. 4

12:10 – 12:30

Ocena fragmentacji DNA – ćw. 5

12:30 – 13:30

Przygotowanie bibliotek DNA do sekwencjonowania –  wykład II

12:30 – 13:00

Przygotowanie biblioteki – ćw. 6

Część A. Naprawa końców pofragmentowanego DNA

13:00 – 14:00

Sekwenatory nowej generacji (NGS) – ich możliwości i ograniczenia w sekwencjonowaniu genomów - wykład III

14:00 – 14:30

Przerwa

14:30 – 15:10

Przygotowanie biblioteki – ćw. 6

Część B. Oczyszczanie po naprawie końców

15:10 – 15:50

Przygotowanie biblioteki – ćw. 6

Część C. dA-Tiling

15:50 – 16:10

Przygotowanie biblioteki – ćw. 6

Część D. Oczyszczanie po tilingu

II dzień

09:00 – 09:40

Przygotowanie biblioteki – ćw. 6

Część E. Ligacja adapterów – ćw. 10

09:40 – 10:00

Przygotowanie biblioteki – ćw. 6

Część F. Oczyszczanie po ligacji

10:00 – 10:15

Przygotowanie biblioteki – ćw. 6

Część G. Amplifikacja biblioteki

10:15 – 11:15

Resekwencjonowanie i składanie de novo genomów - wykład IV

11:15 – 11:30

Przerwa

11:30 – 12:00

Przygotowanie biblioteki – ćw. 6

Część H. Oczyszczanie biblioteki

12:00 – 12:30

Pomiar stężenia przygotowanej biblioteki – ćw. 7

12:30 – 13:00

Ocena wielkości wbudowanych fragmentów – ćw. 8

13:00 – 14:00

Demo - sekwenatory nowej generacji

14:00

Zakończenie

 

Prowadzący: dr hab. Tadeusz Malewski,

Termin: 07 – 08 kwietnia  2017 roku

Miejsce: Muzeum i Instytut Zoologii PAN, ul. Wilcza 64 Warszawa

 

Karty Zgłoszenia oraz opłaty należy przesyłać do dnia 31 marca 2017 r.

 

Ponieważ ilość miejsc jest ograniczona organizatorzy zastrzegają sobie prawo do wcześniejszego zamknięcia listy w przypadku wyczerpania wolnych miejsc.

                                                                      

Dodatkowych informacji udziela:

 

Dr Arleta Malewska: mbs@mbs.biz.pl, Tel (22) 668 24 83;  607  929 471

 

Opłata za udział w kursie wynosi 1200 zł netto + 23% VAT.

Zamawiający zwolniony z podatku VAT proszony jest o dostarczenie drogą elektroniczną (e-mail: mbs@mbs.biz.pl)  stosownego oświadczenia

 

Opłata obejmuje:

  • udział w szkoleniu
  • materiały szkoleniowe
  • przerwy kawowe
  • konsultacje z prowadzącymi

 

Opłatę należy wpłacić na konto:

MBS Szkolenia, Konferencje, Usługi Sp. z o.o.

03-766 Warszawa, ul. Grajewska 6/8 m. 26

 

Bank Polska Kasa Opieki S.A. Oddział w Warszawie

80 1240 6074 1111 0010 4915 6042 

NIP 113 286 12 19;  REGON 146448470; KRS 0000444499

 

Przy wpłacie prosimy o podanie nazwiska osoby, której udział w kursie jest opłacany.

Uczestnicy otrzymają certyfikat ukończenia szkolenia

Newsletter