Oto zagadnienia, które zostaną poruszone podczas kursu:
 |
Dzień I: Bazy danych i analiza sekwencji (wykład + zajęcia komputerowe)  Bazy danych genomowych, ortologii oraz ścieżek metabolicznych. Analiza filogenetyczna sekwencji, analiza rekombinacji. Analiza porównawcza genomów prokariotycznych. Identyfikacja sekwencji profagowych. |
|
Dzień II: Składanie i adnotacja genomów prokariotycznych (wykład + zajęcia komputerowe) Filtrowanie i wstępna obróbka danych. Składanie genomów bakteryjnych i wirusowych w oparciu o różne technologie sekwencjonowania nowej generacji. Adnotowanie genomu. Resekwencjonowanie genomów i wyszukiwanie polimorfizmów. Analiza ekspresji różnicowej genów w oparciu o RNA-Seq. |
|
Dzień III: Metagenomika (wykład + zajęcia komputerowe) Analiza składu gatunkowego w oparciu o 16S rRNA. Analiza sekwencji metagenomowych – wykrywanie genów, analizy porównawcze i funkcjonalne. |
Zachęcamy do rejestrowania się. Koszt uczestnictwa wynosi 900 zł.
Od uczestników kursu nie jest wymagana umiejętność programowania.
Informacje organizacyjne można znaleźć na stronie FAQ.
