Oto zagadnienia, które zostaną poruszone podczas kursu:
 |
Poznajemy język Python W tej części kursu dowiemy się czym jest język Python i jak możemy go wykorzystać w biologii. Poznamy podstawowe instrukcje (if, while oraz for) i struktury danych (lista i słownik). Napiszemy pierwszy program. Nauczymy się odczytywać dane z pliku i dokonywać ich obróbki. Poznamy także podstawowe funkcje języka Python i dowiemy się jak tworzyć własne funkcje. |
|
Pracujemy na danych biologicznych: BioPython Poznamy BioPythona, bioinformatyczną bibliotekę języka Python. Dowiemy się, jak parsować biologiczne formaty plików (m.in. FASTA i GenBank). Nauczymy się analizować pliki wynikowe programów BLAST i BLAT. Ponadto połączymy się zdalnie z biologicznymi bazami danych by efektywnie je przeszukiwać i pobierać z nich dane. |
|
Realizujemy zaawansowane zadania Nauczymy się tworzyć logo sekwencji; będziemy pracować z plikami zawierającymi adnotacje (BED, GTF); wykonamy analizy statystyczne i dowiemy się jak tworzyć zaawansowane wykresy; wykonamy podstawową obróbkę danych NGS. |
|
Projekt Podczas kursu każdy uczestnik wykona dwa projekty pozwalające sprawdzić zdobytą wiedzę i umiejętności. Będą one polegały na napisaniu i uruchomieniu programów w języku Python. |
Zachęcamy do rejestrowania się. Koszt uczestnictwa wynosi 700 zł.
Od uczestników kursu nie jest wymagana umiejętność programowania.
Informacje organizacyjne można znaleźć na stronie FAQ.
