OCENA SEKWENCJI DNA
PROJEKTOWANIE STARTERÓW I SOND DO PCR I REAL TIME PCR
O skutecznym przebiegu reakcji PCR oraz Real-Time PCR (qPCR) decydują właściwie dobrane startery i sondy. Dobór optymalnych warunków reakcji gwarantuje maksymalną wydajność oraz specyfikę zachodzącej amplifikacji. Reakcja qPCR umożliwia nie tylko pomiar tempa ekspresji genów, genotypowanie, identyfikację gatunków i szczepów ale również materiał do sekwencjonowania DNA. Otrzymane sekwencje należy ocenić, złożyć w większą całość i zdeponować w GenBank. Podczas warsztatów uczestnicy będą mogli zapoznać się z projektowaniem starterów i sond, edycją i składaniem sekwencji DNA oraz deponowaniem sekwencji w GenBank.
I DZIEŃ |
|
09:00 – 09:15 |
Otwarcie kursu |
09:15 – 10:15 |
Sekwencjonowanie i tworzenie kontigów DNA – wykład I |
10:15 – 11:15 |
Programy do oceny jakości sekwencji, przyrównania i budowy kontigów DNA – wykład II |
11:15 – 11:30 |
Przerwa |
11:30 – 12:30 |
Edycja, składanie oraz określanie konsensusowej sekwencji DNA. (Programy CAP3, MEGA6) – ćwiczenie 1 |
12:30 – 13:45 |
Przyrównanie sekwencji, znajdowanie sekwencji homologicznych – ćwiczenie 2 |
13:45 – 14:00 |
Przerwa |
14:00 – 15:00 |
Struktura rekordu i deponowanie sekwencji w GenBank – wykład III |
15:00 – 16:00 |
Deponowanie sekwencji DNA w GenBank - ćwiczenie 3 |
II DZIEŃ |
|
09:00 – 10:00 |
Projektowanie starterów do PCR – wykład IV |
10:00 – 11:30 |
Projektowanie starterów do PCR (zwykłe, multipleks, uniwersalne) – ćwiczenie 4 |
11:30 – 11:45 |
Przerwa |
11:45 – 12:45 |
Wyszukiwanie i projektowanie sond do qPCR – wykład V |
12:45 – 14:15 |
Wyszukiwanie i projektowanie sond do qPCR – ćwiczenie 5 |
14:15 |
Zakończenie |
Prowadzący: Dr hab. Tadeusz Malewski
Termin: 15 - 16 luty 2018 roku
Miejsce: Centrum Edukacyjne Pankiewicza, ul. Pankiewicza 3, Warszawa
Karty Zgłoszenia oraz opłaty należy przesyłać do dnia 9 lutego 2018 r.
Ponieważ ilość miejsc jest ograniczona organizatorzy zastrzegają sobie prawo do wcześniejszego zamknięcia listy w przypadku wyczerpania wolnych miejsc.
Dodatkowych informacji udziela:
Dr Arleta Malewska: mbs@mbs.biz.pl, Tel (22) 668 24 83; 607 929 471
Opłata za udział w kursie wynosi 1400 zł netto + 23% VAT.
Zamawiający zwolniony z podatku VAT proszony jest o dostarczenie drogą elektroniczną
(e-mail: mbs@mbs.biz.pl) stosownego oświadczenia
Opłata obejmuje:
Opłatę należy wpłacić na konto:
MBS Szkolenia, Konferencje, Usługi Sp. z o.o.
03-766 Warszawa, ul. Grajewska 6/8 m. 26
Bank Polska Kasa Opieki S.A. Oddział w Warszawie
80 1240 6074 1111 0010 4915 6042
NIP 113 286 12 19; REGON 146448470; KRS 0000444499
Przy wpłacie prosimy o podanie nazwiska osoby, której udział w kursie jest opłacany.
Uczestnicy otrzymają dyplom ukończenia szkolenia