Podczas warsztatów uczestnicy zapoznają się z poszczególnymi etapami badań od sekwencjonowania próbki DNA do zbudowania i oceny drzewa filogenetycznego. Warsztaty umożliwiają praktyczne zapoznanie się z programami do projektowania starterów, porównywania sekwencji DNA i białek oraz budowy i oceny drzew filogenetycznych. Wykłady pozwolą na usystematyzowanie oraz poszerzenie wiedzy z filogenetyki, programów komputerowych oraz ich zastosowania do badań filogenetycznych. Warsztaty skierowane są do osób zamierzających prowadzić badania w oparciu o sekwencje DNA oraz białek, jak również zainteresowanych zastosowaniem nowych sposobów analizy komputerowej do badań prowadzonych klasycznymi metodami.
|
09:00 – 09:10 |
Otwarcie warsztatów |
|
09:10 – 10:30 |
Podstawowe zasady konstruowania drzew filogenetycznych - wykład |
|
10:30 – 11:30 |
Metody konstrukcji i ocena wiarygodności drzew - wykład |
|
11:30 – 11:45 |
Przerwa |
|
11:45 – 12:45 |
Programy do analiz filogenetycznych - wykład |
|
12:45 – 13:45 |
Dopasowywanie sekwencji (Clustal W, BLAST i inne) – ćwiczenie 1 |
|
13:45 – 14:00 |
Przerwa |
|
14:00 – 15:00 |
Wybór modelu substytucji – ćwiczenie 2 |
|
15:00 – 16:00 |
Konstruowanie i ocena drzew filogenetycznych, program MEGA5 – ćwiczenie 3 |
|
16:00 |
Zakończenie warsztatów |
