Biotechnologia.pl
łączymy wszystkie strony biobiznesu

Farmacja, Biotechnologia

Annotacja genomów i proteomów u eukariota
Data rozpoczęcia:
2015-03-06
Data zakończenia:
2015-03-07
Miejsce
Warszawa

Sekwencjonowanie genomu jest dopiero początkiem zrozumienia podstaw funkcjonowania organizmu na poziomie molekularnym. Kolejnym etapem w rozszyfrowywaniu genomu jest odnalezienie w nim sekwencji kodujących białka oraz RNA nie kodujących białek (miRNA, ncRNA, lcnRNA i inne) a następnie przewidzenie ich funkcji w organizmie. Transkrypcja genów jest regulowana przez wiele czynników, część z nich można zidentyfikować stosując analizę sekwencji DNA in silico. Funkcja genów jest często ewolucyjnie konserwatywna. Porównanie annotacji ortologicznych genów u różnych organizmów jest dobrym podejściem do przewidzenia funkcji genu. Można to zrobić poprzez porównanie sekwencji DNA i/lub białek lub metodami ab initio poprzez wyszukiwanie charakterystycznych elementów strukturalnych i sygnałów molekularnych.

 

 

I dzień

09:00 – 09:10

Otwarcie szkolenia

09:10 – 10:30

Annotacja sekwencji DNA - wykład

10:30 – 11:30

Programy do annotacji sekwencji DNA - wykład

11:30 – 11:45

Przerwa

11:45 – 12:45

Annotacja sekwencji DNA eukariota, znajdowanie sekwencji kodujących (programy AUGUSTUS, GeneID, GBF) - ćwiczenie

12:45 – 13:45

Identyfikacja genów, których ekspresja może być regulowana przez miRNA (ComiR,  miRmap)  - ćwiczenie

13:45 – 14:15

Przerwa

14:15 – 15:15

Znajdowanie promotorów RNA polimerazy II i III typu, wysp CpG, miejsc poliadenylacji - ćwiczenie

15:15 – 16:15

Annotacja sekwencji białek - wykład

II dzień

09:00 – 10:30

Transkrypcja, regulacyjne rejony genów i ich struktura - wykład

10:30 – 11:30

Programy i metody bioinformatycznej analizy transkrypcji  - wykład

11:30 – 11:45

Przerwa

11:45 – 13:00

Identyfikacja miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych w promotorach - ćwiczenie

13:00 – 15:00

Annotacja sekwencji białek - ćwiczenie

15:00

Zakończenie szkolenia

 

Prowadzący: Dr hab. Tadeusz Malewski

 

Termin: 6 – 7 marca 2015 roku

 

Miejsce: BIT Polska, ul. Ostrobramska 101A, Warszawa

 

 

Karty Zgłoszenia oraz opłaty należy przesyłać do dnia 27 lutego 2015 r.

 

Ponieważ ilość miejsc jest ograniczona organizatorzy zastrzegają sobie prawo do wcześniejszego zamknięcia listy w przypadku wyczerpania wolnych miejsc.

                                                                      

Dodatkowych informacji udziela:

Dr Arleta Malewska: mbs@mbs.biz.pl, Tel (22) 401 10 38;  607  929 471

 

Opłata za udział w kursie wynosi 1420 zł brutto.

 

Opłata obejmuje:

  • udział w szkoleniu
  • materiały szkoleniowe
  • przerwy kawowe
  • konsultacje z prowadzącymi

 

Newsletter