W najnowszym internetowym wydaniu Nature zespół japońskich i amerykańskich naukowców opublikował wyniki badań prowadzone na genomie muszki Drosophila z wykorzystaniem interferencji RNA (RNAi) wskazujące geny biorące udział w replikacji wirusa grypy u tego organizmu. Cykl życiowy wszystkich wirusów opiera się na wykorzystaniu białek dostępnych w komórkach gospodarza. Identyfikacja tych kluczowych w rozwoju wirusa molekuł może prowadzić do opracowania efektywnych terapii przeciwwirusowych. Wykorzystując konwencjonalne metody bazujące na hodowlach komórek ssaczych jest to zadanie bardzo czasochłonne. Naukowcy proponują szybszą metodę opartą na "przeszukiwaniu" genomu w poszukiwaniu takich genów, których produkty potencjalnie mogą pomagać w rozwoju wirusa w komórce. Pierwszy etap badań obejmował modyfikację wirusa w taki sposób, aby był on w stanie zarazić komórki muszki. Po detekcji ekspresji genów wirusowych przetestowano bibliotekę RNAi dla 90% genów Drosophila, co zaowocowało identyfikacją około stu genów. Supresja tych genów powodowała zmianę w ekspresji genu reporterowego (lucyferazy) znajdującego się na wektorze wirusowym. W zakresie zidentyfikowanych genów znajdują się takie, których ssacze homologi znane są z kluczowych funkcji podczas replikacji szczepów H5N1 oraz H1N1 wirusa grypy. Badacze utrzymują, że ich doświadczenia pokazały użyteczność screeningów całego genomu z wykorzystaniem RNAi i muszki Drosophila jako organizmu modelowego w celu identyfikacji nieznanych genów biorących udział w rozwoju wirusa u gospodarza. Ma to przyspieszyć rozwój leków przeciwwirusowych w świetle zagrożenia pandemią grypy oraz pojawiania się szczepów opornych na obecnie dostępne leki.


Źródło: Linhui Hao, Akira Sakurai, Tokiko Watanabe, Ericka Sorensen, Chairul A. Nidom, Michael A. Newton, Paul Ahlquist, Yoshihiro Kawaoka; Drosophila RNAi scre